Zaliczenie 60 godz. lektoratu z języka obcego odbywa się w formie zaliczenia na ocenę i jest realizowane w Jagiellońskim Centrum Językowym (na II lub III roku dla osób które rozpoczęły studia w roku 2011/2012 lub wcześniej; na II roku dla doktorantów wpisanych na I rok studiów w roku akademickim 2012/2013 lub później). Zapisy na lektoraty dla doktorantów prowadzone będą osobiście lub przez stronę internetową USOSweb. W ramach lektoratu istnieje możliwość uczestniczenia w tzw. modułowych kursach specjalistycznych. Doktorant, który skorzysta z tej oferty, uzyskuje zaliczenia na zasadach ogólnych.
Doktoranci posiadający certyfikaty (bądź inne dokumenty) potwierdzające znajomość języka obcego na określonym poziomie mogą uzyskać zaliczenie bez konieczności uczestniczenia w lektoracie. Zaliczenia w takim przypadku może dokonać tylko lektor Jagiellońskiego Centrum Językowego.
Egzamin z języka obcego w przewodzie doktorskim (poziom C1) winien być poprzedzony obowiązkowymi konsultacjami (bezpłatnymi), które ustala lektor na co najmniej pół roku przed planowanym egzaminem. Doktorant zostanie dopuszczony do egzaminu doktorskiego tylko w sytuacji, gdy uzyskał wpis w indeksie potwierdzający odbycie konsultacji.
W Instytucie Filozofii jest obowiązek zaliczenia języka klasycznego (poza językiem nowożytnym) w minimalnym wymiarze 60 godz. Obowiązek ten należy zrealizować na dowolnym roku studiów.
